Во вселенной будущего, во втором тысячелетии, человечество сталкивается с внезапной космической угрозой — агрессивных юпитерианских ящеров. Спустя год после нападения на земную колонию на Марсе Акито, чудом переживший катастрофу, просыпается на Земле без понятия, как туда попал и что произошло. Он вынужден подрабатывать поваром и пытается разобраться в случившемся, не находя ответов. Всё меняется после случайной встречи с Юрикой — давней подругой детства, которая оказывается капитаном нового корабля «Надэсико». Этот корабль, построенный частной фирмой «Нергал» для выхода из кризиса и поиска выхода из конфликта, устремляется в путь. Следуя за Юрикой, Акито обретает надежду на объяснения и в итоге становится членом экипажа — команды людей с необычными характерами и истинными «чудаками», таких же, как и капитан. Преодолевая сопротивление, «Надэсико» уходит в долгий рейс к Марсу, где, возможно, раскроется тайна смерти родителей Акито.
