После неловкого эпизода на выпускном старшеклассники Дзёгоро Кобато и Юки Осанаи решают начать новую страницу своей школьной жизни — тихую, незаметную и не привлекающую лишнего внимания. Они заключают неформальное соглашение стать «маленькими гражданами» — людьми, которые не лезут на глаза и держатся подальше от неприятностей. Но их стремление к спокойствию часто рушится: школьные интриги, странные происшествия и загадочные тайны будто сами находят их. Кобато, пытаясь держаться в стороне, всё равно остаётся острым умом и внимательным наблюдателем, что невольно втягивает его в расследования. Осанаи за своей сдержанностью явно прячет что-то важное, и эта тайна лишь добавляет напряжения, подталкивая их к встречам с непредвиденными событиями.
