Кобато — милая и в какой‑то степени наивная девушка, которая отправляется на Землю ради осуществления своей заветной мечты. Чтобы её достичь, ей предстоит лечить раны сердец людей, заполняя волшебную бутылочку осколками их страданий, превращая эти мелкие фрагменты в силу исцеления. Проводником в мире людей для неё становится Иорёги — могущественное магическое существо, в образе синего плюшевого пса. По прибытии на Землю Кобато сталкивается с суровой реальностью: она почти ничего не знает о людях и их быте, а всё её мировоззрение опирается на страницы манги. Но несмотря на странности и невежество, оказывается, что она прекрасно подготовлена к миссии: её сердце полно добра и сострадания, она искренне желает помогать окружающим. Ей удаётся быстро завоевать доверие и восхищение тех, кому она помогает, однако ей не позволено раскрывать свои чувства к тем, чьи сердца она исцеляет.
