В 2012 году Японию настигли Мю — гуманоидные существа с голубой кровью, прибывшие из иного измерения. В 2015-м захватчики пытаются захватить Токио, но отпрыгивают под натиском странного оружия, именуемого «долем». В разгар хаоса молодой Аято Камина встречает одноклассницу Рэйку Мисиму. В тот же день город подвергается нападению со стороны правительственных сил, однако на помощь приходит загадочная женщина Харука Сито, заявляющая, что её направила организация «TERRA», и что Токио запечатан в временной трещине, где время идёт лишь около трети обычного темпа. Аято прячется от Харуки и запрыгивает на поезд, где вновь сталкивается с Рэйку. По прибытии в Зал Ра он следует за ней к гигантскому яйцу, из которого вылупился долем Ра-Зефон. Внезапно на вершине долема появляется мать Аято и прерывает вторжение «TERRA». В бою она получает рану, и, увидев её голубую кровь, Аято вместе с Харуки Сито уходят прочь.
