Действие разворачивается в январе 2118 года: Аканэ Цунэмори, ныне исполняющая обязанности главного инспектора Бюро общественной безопасности, узнаёт о загадочном инциденте на иностранном судне. Ей и Ацуси Синдо, возглавляющему отдел статистики Министерства здравоохранения и социального обеспечения, приходится спешить к месту происшествия, однако по неизвестной причине расследование передаётся Исполнительному отделу бюро по координации действий за рубежом Министерства иностранных дел. На корабле обнаружена труп Доктора Милиции Стронской, которую Ацуси пригласил в качестве гостя. За случившимся стоит таинственная организация «Нарушители мира», которую Исполнительный отдел давно пытался преследовать. Первый отдел департамента уголовного розыска приходит к выводу, что инцидент связан именно с этой группировкой и их интересом к так называемому «Документу Стронской», после чего формируется совместная комиссия с Департаментом поведенческих расследований. В составе команды появляется Шинью Когами, ранее бывший беглец из Бюро общественной безопасности. Совместно с Дзёдзи Сайгой, последним, кто разговаривал с доктором Стронской, они отправляются в Дэдзиму ради получения документа. Акaнэ и Когами сталкиваются с неожиданно масштабным делом, тесно переплетённым с «Документом Стронской». Скрытая истина, способная поколебать японское правительство и систему «Сибилла», готова раскрыться впервые. Это не просто недосказанная история: она становится связующим звеном между фильмом и сериями, соединяющими вселенную Psycho-Pass — от прошлых событий до новой главы, где границы между законом и тенями начинают стираться.