Молодой Дзиро возвращается домой и сталкивается с жестокой правдой: его мать и сестра убиты при загадочных обстоятельствах. Неправомерно обвинённый в преступлении, он вынужден бежать из родной деревни. По пути судьба сводит его с таинственным священником по имени Тэнкай, чьи суровые методы заставляют Дзиро поддаться давлению и уничтожить отступника-ниндзя по прозвищу Тародза. Выполнив приказ, молодой человек становится на путь убийцы и вскоре поднимается до уровня мастера скрытого боя. Спустя годы Дзиро узнаёт, что он сирота: его биологическим отцом был сам Тародза, когда-то работавший на Тэнкая, но покинувший миссию после того, как влюбился в женщину из народа айнов. Затем отправляется новая крупная развязка: сёгунат планирует раскопать утраченный сундук Капитана Кидда и применить его, чтобы снова изолировать Японию от остального мира. Драгоценные зашифрованные подсказки, тайно хранённые Тародзой, побуждают Дзиро вместе с девушкой-ниндзя Оюки и рабом по имени Сэм отправиться в Россию и Америку в поисках сокровища, надеясь с его помощью отомстить Тэнкаю.
