Когда-то прославленный учёный по имени Юнг Зорндайк открыл новый вид существ, обосновавшихся на морском дне и нападающих на людей. Он был уверен, что эра человечества на Земле давно истекла и их влияние следует завершить. Но общество не готово смириться с такой участью. Чтобы положить конец безумию Зорндайка и его творений, возник Синий флот — объединение сил, среди которых ярко выделялась Синяя субмарина №6. Экипаж борется с таинственными подводными угрозами и зловещими намерениями, скрытыми под волнами. Вокруг них рождается целый мир загадок: мотивы учёного, тени науки и цена человеческого выживания. Встреча с противником заставляет героев переосмыслить своё место в природе и цену силы. В кульминации подводная битва становится не просто схваткой за власть над океаном, а сражением за будущее цивилизации и восстановление гармонии поверхностного мира.
