Под толщей океанской глубины Арсен Люпен III снова погружается в рискованную охоту за древним сокровищем, надеясь заполучить благосклонность Фудзико Минэ. В то же время Коити Дзэнигата неустанно преследует их и на суше, и на море, в то время как люди из окружения банды начинают таинственно исчезать без следа. Сгущается туман, и яркая вспышка света выхватывает из темноты нового врага — Мамо Кёсукэ, уверяющего, что прибыл из будущего, и намеренного отомстить Люпену III за деяния Люпена Гоэмона Исикавы XIII. Мамо силой закидывает Люпена, Дзигэна, Гоэмона и Дзэнигату на 500 лет назад — туда, где две враждующие фракции ведут жестокую схватку за легендарное святилище, посвящённое путешествиям во времени. Теперь Люпену предстоит выстоять в прошлом, чтобы обеспечить себе дорогу в будущее.
